chmod +x /path/to/python/scripts/dir/*.py
Выполнит исполняемый файл всеми текущими файлами .py в каталоге /path/to/python/scripts/dir.
Я не знаю об автоматическом инструменте, как вы описываете. Возможно, в вашем редакторе может быть макрос, но это не тот редактор, который я использую. -
)