Если вы можете расшифровать или смонтировать только один файл, он будет использовать те же ключи, что и все другие зашифрованные файлы, поэтому я не вижу преимуществ перед тем, как регулярно монтировать зашифрованный дом.
Если вы хотите создать еще одну незашифрованную папку в другом месте для хранения каталога ~/.config/transmission/resume или целого ~/.config/transmission, вы можете выполнить привязку привязки:
mount --bind olddir newdir
и не нужно будет использовать отдельный раздел или диск, может поместить newdir в / или /home или в любом месте.