Где найти полную документацию для меню, используемого в файле 40_custom grub?

Это действительно большая работа для SSH (как указывали другие), но если вы решили использовать ftp, попробуйте lftp. Он свободно доступен для всех поддерживаемых в настоящее время версий Ubuntu. Вы можете установить его с помощью команды sudo apt install lftp

lftp -u username,password -e "your command;quit" ftp.site.com

lftp документирует переключатель -c, который запускает команду, а затем завершает работу, но в большинстве дистрибутивов он разбивается. -e будет поддерживать связь, если вы не выдадите quit.