Работа с зараженным сервером (VPS)

У меня есть VPS Ubuntu Server 16.04, работающий с OVH. Около 10 веб-сайтов (последняя версия CMS) заражены, я не знаю, какой тип заражения есть, но каждый js на сервере превращается в «eval». Я проверил свой VPS с помощью clamav, но ничего не нашел.

Каковы способы избавиться от этого вредоносного ПО без полной переустановки ОС?