Я понимаю, что при создании USB-накопителя с приложением Ubuntu Live USB Creator можно зарезервировать место для хранения данных и пакетов, установленных «сверху» образа ISO. То есть (! d0)
Подробнее см. в вики Ubuntu.
Если ваш USB-накопитель был создан без этой опции (т. е. было выбрано что-то вроде «отменить изменения при выключении»). Я боюсь, что самым легким было бы воссоздать диск, потому что это в основном файловая система ISO (то есть образ компакт-диска), и она не должна записываться в один раз .