Это не столько вирусы, сколько руткиты, которые опасны для Linux. Просто будьте осторожны с командами root, sudo и su.
Не определен для Boost, но для получения файлов заголовков (например: bzlib.h) для библиотеки вам необходимо установить для него пакеты dev:
sudo apt-get install libbz2-dev
Как правило, для найти в каких пакетах содержится файл, используйте apt-file:
sudo apt-get install apt-file
apt-file update
apt-file search bzlib.h
Я думаю, что есть мета-пакет для библиотек boost, хотя, хотя я не помню названия для него. [ ! d2]