У меня была такая же проблема. Это оказалось mysql my.cnf master slave replications. Проверьте /var/log/mysql/error.log.
Надеюсь, это немного поможет. Сначала проверьте настройки mysql, прежде чем потратить два часа на работу с помощью apparmor, который просто отлично работает.