Я установил OpenMPI и пакет под названием CVODE на мою систему Ubuntu, которая работает на виртуальной машине (с использованием VirtualBox). Была одна проблема, которая была решена путем копирования некоторых файлов библиотеки в /usr/lib. Другими словами, произошло следующее, когда я попробовал примеры программ, которые поставлялись с CVODE:
$ mpirun ./cvAdvDiff_bnd
cvAdvDiff_bnd: error while loading shared libraries: libsundials_cvode.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
$ sudo cp /home/jeff/sundials/instdir/lib/libsundials_cvode.so.1 /usr/lib/libsundials_cvode.so.1
$ mpirun cvAdvDiff_bnd
cvAdvDiff_bnd: error while loading shared libraries: libsundials_nvecserial.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
$ sudo cp /home/jeff/sundials/instdir/lib/libsundials_nvecserial.so.0 /usr/lib/libsundials_nvecserial.so.0
$ mpirun cvAdvDiff_bnd
2-D Advection-Diffusion Equation
Mesh dimensions = 10 X 5
Total system size = 50
Tolerance parameters: reltol = 0 abstol = 1e-05
At t = 0 max.norm(u) = 8.954716e+01
At t = 0.10 max.norm(u) = 4.132889e+00 nst = 85
At t = 0.20 max.norm(u) = 1.039294e+00 nst = 103
At t = 0.30 max.norm(u) = 2.979829e-01 nst = 113
At t = 0.40 max.norm(u) = 8.765774e-02 nst = 120
At t = 0.50 max.norm(u) = 2.625637e-02 nst = 126
At t = 0.60 max.norm(u) = 7.830425e-03 nst = 130
At t = 0.70 max.norm(u) = 2.329387e-03 nst = 134
At t = 0.80 max.norm(u) = 6.953434e-04 nst = 137
At t = 0.90 max.norm(u) = 2.115983e-04 nst = 140
At t = 1.00 max.norm(u) = 6.556853e-05 nst = 142
Final Statistics:
nst = 142 nfe = 174 nsetups = 23 nfeLS = 0 nje = 3
nni = 170 ncfn = 0 netf = 3
Проблемы с поиском этих двух файлов были решены путем копирования их на /usr/lib. Однако в ~/sundials/instdir/lib/ есть сотни файлов.
Как я могу заставить Ubuntu искать эти файлы в их текущем местоположении, а не копировать их все в /usr/lib/?