Если я ищу rdkit с
apt search rdkit
, я получаю «python-rdkit / xenial 201503-3 amd64» в качестве одной из записей. Номер версии говорит 201503-3.
Я просто попытался установить его, как вы, выполнив
sudo apt install python-rdkit
Когда я импортирую и проверяю версию:
>>> rdkit.rdBase.rdkitVersion
'2015.03.1'
Это более поздняя версия, чем ваша, по крайней мере, возможно, попробуйте переустановить?
Также обратите внимание, что это для python 2.7.12