apt-get ошибки после обновления TeX Live 2012 с помощью tlmgr

Я запускаю TeX Live 2012 на Ubuntu Precise. Для установки я последовал этому руководству. Вчера я обновил пакеты (около 40 элементов) для Tex Live 2012, используя следующий инструмент.

$ sudo tlmgr --gui

Обновления были успешно установлены и все еще работало.

Сегодня, Я заметил, что apt-get выводит ошибки при запуске sudo apt-get install something или sudo apt-get autoremove. Вот вам консольный вывод последней команды.

$ sudo apt-get autoremove 
Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
3 not fully installed or removed.

After this operation, 0 B of additional disk space will be used.
Setting up texlive-base (2009-15) ...
mktexlsr: Updating /var/lib/texmf/ls-R-TEXMFMAIN... 
mktexlsr: Updating /var/lib/texmf/ls-R-TEXLIVE... 
mktexlsr: Updating /var/lib/texmf/ls-R... 
mktexlsr: Done.

texconfig: unknown option `paperconf' given as argument for `texconfig dvips'
texconfig: try `texconfig dvips' for help
texconfig: unknown option `paperconf' given as argument for `texconfig dvipdfmx'
texconfig: try `texconfig dvipdfmx' for help
texconfig: unknown option `paperconf' given as argument for `texconfig xdvi'
texconfig: try `texconfig xdvi' for help
texconfig: unknown option `paperconf' given as argument for `texconfig pdftex'
texconfig: try `texconfig pdftex' for help
texconfig: unknown option `paperconf' given as argument for `texconfig dvips'
texconfig: try `texconfig dvips' for help

dpkg: error processing texlive-base (--configure):
 subprocess installed post-installation script returned error exit status 1
dpkg: dependency problems prevent configuration of texlive-latex-base:
 texlive-latex-base depends on texlive-base (>= 2009-1); however:
  Package texlive-base is not configured yet.
dpkg: error processing texlive-latex-base (--configure):
 dependency problems - leaving unconfigured
dpkg: dependency problems prevent configuration of texlive-bibtex-extra:
 texlive-bibtex-extra depends on texlive-latex-base (>= 2009-1); however:
  Package texlive-latex-base is not configured yet.
dpkg: error processing texlive-bibtex-extra (--configure):
 dependency problems - leaving unconfigured

No apport report written because the error message indicates its a followup 
error from a previous failure.
No apport report written because the error message indicates its a followup 
error from a previous failure.

Errors were encountered while processing:
 texlive-base
 texlive-latex-base
 texlive-bibtex-extra

Сам LaTeX по-прежнему отлично работает, насколько я могу видеть.

Примечание. На всякий случай следующее должно что-то сделать с основной проблемой. Я также заметил, что человеческий путь больше не указывает на обычные папки. этот учебник описан ранее. Однако я не мог решить это на своей машине.

$ echo $MANPATH
/usr/local/texlive/2012/texmf/doc/man