Калибр - это программное обеспечение, которое вы хотите использовать.
Что касается получения Ubuntu для распознавания Kindle, попробуйте прочитать следующий поток. По сути, новые Kindles используют MTP вместо обычного протокола устройств хранения, который по умолчанию не установлен в Ubunutu. Управление Kindle Fire с 12.04 через Micro-USB