как разбить все файлы в каталоге на 4gb-файлы на другой каталог?

Вы выполняете 11.04 или 11.10?

Попробуйте перезапустить nautilus с помощью:

nautilus -q

Это прекратит ваш текущий сеанс nautilus. Если он не перезапускается автоматически, вы можете запустить nautilus с терминала или открыть папку. Это должно работать и быть менее экстремальным, чем полностью перезапустить X.

Надеюсь, что это поможет!