Сделайте свой ~/.byobu/keybindings похожим на это:
# source $BYOBU_PREFIX/share/byobu/keybindings/common
. /usr/share/byobu/keybindings/f-keys.screen.disable
и выберите экран как back-end byobu через byobu-select-backend. Это работает, по крайней мере, в Debian.