Ядро Ubuntu не может читать собственный корневой раздел, но LiveCDs может?

Из сообщения предварительной загрузки я полагаю, что вы устанавливаете неправильную архитектуру.

Но если вы находитесь в системе x64, это неизбежно, так как вы также можете запускать 32-битные программы, поэтому esets устанавливает 64-битную программу, которая не может предварительно загружать 32-битную библиотеку, 32-битная программа не может загружать 64-битную библиотеку.

Единственный способ избавиться от этого - сделать все ваши 32-битные системы.