Я использовал gparted безопасно на ext [234], fat32 и NTFS разделах. Я думаю, из вашего вопроса, что у вас нет резервной копии ваших данных, поэтому вы приняли риск потерять свои данные, если диск не работает, вы проливаете чашку чая над ним и т. Д. В этом случае дополнительный риск, вызванный Использование gparted кажется незначительным.
Если вы можете позволить себе внешний жесткий диск, я предлагаю вам выполнить резервное копирование, неважно, используете ли вы gparted или нет.