Как я могу установить rjags на Ubuntu AMI на EC2?
Я установил предварительно созданный Образ машины Amazon с Сервером Rstudio, обеспеченным биопроводником в свободный микро экземпляр на EC2.
Затем я установил ЯГУАРЫ (Просто Другой Gibbs Sampler для использования его через rstudio сервер.
С этой целью я просто использовал оболочку Сервера Rstudio sudo apt-get install jags который работавший хорошо насколько я могу сказать (если я выполняю его снова, это говорит мне, ЯГУАРЫ актуальны).
Однако, когда я пытался установить пакет "rjags", который является интерфейсом между Rstudio и ЯГУАРАМИ через также biocLite("rjags") или install.packages("rjags"), это перестало работать с сообщением об ошибке
checking for jags_version in -ljags... yes
configure: error: "JAGS module directory /usr/lib64/JAGS/modules-3 does not exist."
ERROR: configuration failed for package ‘rjags’
* removing ‘/home/ubuntu/R/library/rjags’
Warning in install.packages :
installation of package ‘rjags’ had non-zero exit status
Я зарегистрировался в lib64 и, действительно, существует только каталог "зубцы" с "терминалом зубцов" как его содержание.
Я был бы благодарен за любые указатели, я предполагаю, что очевидно, что мне позволили сделать что-то вне моего понимания благодаря большим учебным руководствам.
1 ответ
Как только я сдался, я нашел ответ .
sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter
sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base-dev jags r-cran-rjags
Впоследствии, biocLite("rjags") работает хорошо. Однако, как сообщается в сообщении, JAGS все равно быстро исчерпает микроэкземпляр, так что я больше не пробовал это в комментарии Дирка Эддельбюттеля.