Я имею, устанавливают зашифрованный homedir по данным этого EncryptedHomeDirectoryHowto.

Для получения ssh доступа, я добавил auth required pam_encfs.so кому: /etc/pam.d/sshd

$ cat /etc/pam.d/sshd | egrep -v ^#
auth       required     pam_env.so # [1]
auth       required     pam_env.so envfile=/etc/default/locale
auth       required     pam_encfs.so
@include   common-auth
account    required     pam_nologin.so
@include   common-account
@include   common-session
session    optional     pam_motd.so # [1]
session    optional     pam_mail.so standard noenv # [1]
session    required     pam_limits.so

Это действительно работает в течение короткого времени после входа в систему, но после 5-10min homedir будет размонтирован. Если я зарегистрирован локально, все хорошо работает. Даже ssh от другой машины.

Кажется, что размонтирование сделано каждый раз, крон запускается:

/var/log/auth

Feb 22 19:01:01 xxxxx sshd[12746]: Accepted password for USER from xxx.xxx.xxx.xxx port 39769 ssh2
Feb 22 19:01:01 xxxxx sshd[12746]: pam_unix(sshd:session): session opened for user USER by (uid=0)
Feb 22 19:05:01 xxxxx CRON[13248]: pam_unix(cron:session): session opened for user root by (uid=0)
Feb 22 19:05:01 xxxxx CRON[13248]: pam_unix(cron:session): session closed for user root