Когда вы запускаете приложение, скажем, Firefox, панель запуска продолжает размещаться над ним. Это выясняется путем перемещения мыши к левому краю экрана, а затем в сторону, но это не должно происходить в первую очередь.
Насколько мне удалось определить, это поведение было исправлено с момента выпуска 11.04 - я предлагаю вам поддерживать свою систему в актуальном состоянии. (подробнее об этом , посмотрите на этот вопрос )