После замены ctrl и caps в xmodmap, как я могу сделать ctrl правильно работать для комбинаций с несколькими модификаторами?

Ubuntu Netbook 10.04 не является версией LTS (LTS - это только «классический» сервер Ubuntu и Ubuntu), поэтому обновления нетбуков отсутствуют (10.04.x).

(То же самое как с Kubuntu 8.04.)

https://wiki.ubuntu.com/LTS