Обновлен до Raring Ringtail 13.04, но не каждый пакет сделал?

Nautilus перезапускается, потому что у вас есть рисунок на рабочем столе. Введите

gconftool-2 --type bool --set /apps/nautilus/preferences/show_desktop False

в терминале, чтобы он прекратил это делать, а затем он не должен возвращаться после убийства.