Не могу установить R на Ubuntu 17.10
Я недавно обновился до версии artful и больше не могу установить r-recommended. Я продолжаю получать это сообщение об ошибке:
user@box:~$ sudo apt install r-recommended
[sudo] password for user:
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
Some packages could not be installed. This may mean that you have
requested an impossible situation or if you are using the unstable
distribution that some required packages have not yet been created
or been moved out of Incoming.
The following information may help to resolve the situation:
The following packages have unmet dependencies:
r-recommended : Depends: r-cran-boot (>= 1.2.19) but it is not going to be installed
E: Unable to correct problems, you have held broken packages.
user@box:~$
Тем не менее, https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/artful/ уже доступен.
Редактировать: Как спрашивает @muru в комментариях, выходные данные из sudo apt-get update плюс выходные данные из sudo apt-get upgrade были
user@box:~$ sudo apt update
Hit:1 http://download.virtualbox.org/virtualbox/debian zesty InRelease
Ign:2 http://dl.google.com/linux/chrome/deb stable InRelease
Ign:3 https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu artful/ InRelease
Hit:4 http://dl.google.com/linux/chrome/deb stable Release
Hit:5 https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu artful/ Release
Hit:8 http://archive.ubuntu.com/ubuntu artful InRelease
Hit:9 http://archive.canonical.com/ubuntu artful InRelease
Hit:10 http://archive.ubuntu.com/ubuntu artful-updates InRelease
Hit:11 http://archive.ubuntu.com/ubuntu artful-backports InRelease
Hit:12 http://archive.ubuntu.com/ubuntu artful-security InRelease
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
All packages are up to date.
user@box:~$ sudo apt upgrade
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
Calculating upgrade... Done
0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
user@box:~$
3 ответа
Кажется, существует поврежденная зависимость для r-cran-boot. А именно, это зависит от r-api-3, который больше не существует, будучи измененным на r-api-3.4.
sudo aptitude full-upgrade
The following packages will be upgraded:
r-cran-boot{b}
1 packages upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
Need to get 618 kB of archives. After unpacking 0 B will be used.
The following packages have unmet dependencies:
r-cran-boot : Depends: r-api-3 which is a virtual package and is not provided by any available package
The following actions will resolve these dependencies:
Keep the following packages at their current version:
1) r-cran-boot [1.3-20-1build1 (artful, now)]
Accept this solution? [Y/n/q/?]
Я попытаюсь отправить отчет об ошибках в настоящее время.
Обновление: специалист по обслуживанию пакета, кажется, решил проблему. Я могу обновить, не получая ошибку зависимости.
Для пользователей, которые сталкиваются с этой ошибкой в другой настройке.
У меня это было 18.04 после обновления с 16.04.
У меня было другое зеркало 16.04 для крана. После обновления у меня были проблемы с обновлением r-рекомендованного с таким же выводом.
Как только я удалил список источников, в моем случае cran.mirror.ac.za, обновление все еще не работало с выводом:
The following packages have unmet dependencies:
r-cran-boot : Depends: r-api-3.4
r-cran-class : Depends: r-api-3.4
r-cran-cluster : Depends: r-api-3.4
r-cran-codetools : Depends: r-api-3.4
r-cran-foreign : Depends: r-api-3.4
r-cran-kernsmooth : Depends: r-api-3.4
r-cran-lattice : Depends: r-api-3.4
r-cran-mass : Depends: r-api-3.4
r-cran-matrix : Depends: r-api-3.4
r-cran-mgcv : Depends: r-api-3.4
r-cran-nlme : Depends: r-api-3.4
r-cran-nnet : Depends: r-api-3.4
r-cran-rpart : Depends: r-api-3.4
r-cran-spatial : Depends: r-api-3.4
r-cran-survival : Depends: r-api-3.4
Мне пришлось apt-get remove r-base-core, apt-get clean, а затем я мог установить r-recommended без проблем.
Я думаю, что проблема заключалась в том, что зависимый от пакета r-base-core был установлен из другого репозитория и не обновлялся автоматически с Ubuntu.
Это, возможно, действительно было ситуацией ОП или может представлять то же самое в любом случае, поэтому я подумал, что это может быть полезным ответом.
Действительно, как обозначено Paul Stodghill в его ответе, устанавливающем с aptitude добьется цели, пока Вы знаете, что это предложит сначала ничего не установить - одно бесполезное предложение, которое необходимо отклонить - для, именно тогда, это предложит установить r-cran-boot так или иначе с невстреченной зависимостью от r-api-3.4, как замечено в этом выводе:
user@box:~$ sudo aptitude install r-recommended
The following NEW packages will be installed:
cdbs{a} dh-translations{a} intltool{a} libblas-dev{a} liblapack-dev{a} libncurses5-dev{a} libreadline-dev{a} libtinfo-dev{a} python-pkg-resources{a} python-scour{a}
python-six{a} r-base-core{a} r-base-dev{a} r-cran-boot{ab} r-cran-class{a} r-cran-cluster{a} r-cran-codetools{a} r-cran-foreign{a} r-cran-kernsmooth{a}
r-cran-lattice{a} r-cran-mass{a} r-cran-matrix{a} r-cran-mgcv{a} r-cran-nlme{a} r-cran-nnet{a} r-cran-rpart{a} r-cran-spatial{a} r-cran-survival{a} r-doc-html{a}
r-recommended
0 packages upgraded, 30 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
Need to get 43.5 MB of archives. After unpacking 78.9 MB will be used.
The following packages have unmet dependencies:
r-cran-boot : Depends: r-api-3 which is a virtual package, provided by:
- r-base-core (3.4.2-2zesty), but 3.4.2-2artful4 is to be installed
The following actions will resolve these dependencies:
Keep the following packages at their current version:
1) r-cran-boot [Not Installed]
2) r-recommended [Not Installed]
Leave the following dependencies unresolved:
3) r-base-core recommends r-recommended
Accept this solution? [Y/n/q/?] n
The following actions will resolve these dependencies:
Install the following packages:
1) r-cran-boot [1.3-20-1build1 (artful)]
Accept this solution? [Y/n/q/?] y
The following NEW packages will be installed:
cdbs{a} dh-translations{a} intltool{a} libblas-dev{a} liblapack-dev{a} libncurses5-dev{a} libreadline-dev{a} libtinfo-dev{a} python-pkg-resources{a} python-scour{a}
python-six{a} r-base-core{a} r-base-dev{a} r-cran-boot{a} r-cran-class{a} r-cran-cluster{a} r-cran-codetools{a} r-cran-foreign{a} r-cran-kernsmooth{a}
r-cran-lattice{a} r-cran-mass{a} r-cran-matrix{a} r-cran-mgcv{a} r-cran-nlme{a} r-cran-nnet{a} r-cran-rpart{a} r-cran-spatial{a} r-cran-survival{a} r-doc-html{a}
r-recommended
0 packages upgraded, 30 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
Need to get 43.5 MB of archives. After unpacking 78.9 MB will be used.
Do you want to continue? [Y/n/?] y
Get: 1 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu artful/ r-base-core 3.4.2-2artful4 [23.2 MB]
Get: 2 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu artful/ r-base-dev 3.4.2-2artful4 [4414 B]
(...)
Setting up r-cran-rpart (4.1-11-1build1) ...
Setting up r-recommended (3.4.2-2artful4) ...
Current status: 1 (+1) upgradable.
user@box:~$