Запуск программ на Ubuntu с другой средой

Мне было интересно, будут ли программы работать так же, как обычно, если я изменю DE с Unity (я полагаю, что это Ubuntu по умолчанию) на Deepin 15.10.

Моя главная задача - использовать программное обеспечение для химии (Chemaxon), которое, как мне известно, работает в Ubuntu (должно работать на всех системах на основе Debian), а также программу, написанную парнем из моей исследовательской группы.

Я верю, что ядро ​​Ubuntu не меняется вообще, а только его лицо, верно? Система все еще будет основана на Ubuntu? Так что у меня могут возникнуть проблемы с графическим интерфейсом некоторых программ, но все, что работает на моем Ubuntu 19.04, теперь должно работать после переключения?