Таким образом, автоматические обновления настроены для запуска при каждом выключении, хорошо.
Но до этого момента на рабочем столе Ubuntu 18.04 появился графический интерфейс, в котором говорилось, что XY необходимо обновить.
Большой вопрос: Как мы можем отключить всплывающее окно GUI для пользователей?
Откройте Synaptic Package Manager затем переходят к Настройкам-> Репозитории-> Обновления и сняли флажок Проверка на обновления .
я не уверен, как Вам настраивали необслуживаемые обновления, но если это использует задание крона затем, это должно хорошо работать.