Это зависит от того, как параноидально вы делаете пару лишних записей на SSD :) Некоторые люди очень часто бывают apt-get upgrade.
Но да, любая схема жизнеспособна, и все /home на жестком диске более прямолинейны, а символическая привязка только некоторых каталогов к жесткому диску заставит Firefox и другие приложения начать немного быстрее.
Я нашел решение. Сначала мне пришлось удалить сломанный пакет, используя:
sudo rm /var/cache/apt/archives/wine1.6_1.6~rc2-0ubuntu1~ppa1_i386.deb
Затем попытался снова восстановить сломанные пакеты:
sudo apt-get -f install
Спасибо всем, потому что моя проблема была решена путем объединения некоторых решений здесь.