У меня была эта проблема, а окно Firefox Preferences-> Applications было полностью пустым.
Сделал следующее:
sudo apt-get remove --purge firefox
sudo apt-get install firefox
Исправлены обе проблемы (на данный момент I ', если вы вернетесь назад, и все мои настройки и плагины остаются неповрежденными.