Не знаю, почему, но, по-видимому, проблема в том, что строка
-Dcom.ibm.icu.util.TimeZone.DefaultTimeZoneType=ICU
в конце eclipse.ini решена.
Это потому, что вы установили мод. Вы также удалили папку META-INF. Переименуйте / удалите папку .minecraft и повторите попытку, она будет работать, если присутствует папка META-INF. Файлы lwjgl обновлены в mc1.6, так что это не проблема.