Сбой Python 2.7 в приложении Pymol

Я новичок в Ubuntu, пожалуйста, прости меня за любые логические комментарии.

При попытке загрузить файл pdb в pymol я получу отчет о сбое системы:

ProblemType: Crash
Architecture: amd64
CrashCounter: 1
CurrentDesktop: Unity
DistroRelease: Ubuntu 14.04
ExecutablePath: /usr/bin/python2.7
ExecutableTimestamp: 1434999065
ProcCmdline: python2.7 -m pymol.__init__
ProcCwd: /home/administrator
ProcEnviron:
 LANGUAGE=en_SG:en
 TERM=xterm
 PATH=(custom, no user)
 XDG_RUNTIME_DIR=<set>
 LANG=en_SG.UTF-8
 SHELL=/bin/bash

Я пробовал несколько методов, например. установка драйверов nvidia; обновление до новейшего ядра; переустановка python2.7 и pymol. Но я не могу решить эту проблему.

Это информация о моих системах:

$ lsb_release -a
No LSB modules are available.
Distributor ID: Ubuntu
Description:    Ubuntu 14.04.4 LTS
Release:    14.04
Codename:   trusty

$ uname -r
3.13.0-86-generic


$ lsmod | grep nouv
nouveau              1097288  3 
mxm_wmi                13021  1 nouveau
wmi                    19177  2 mxm_wmi,nouveau
video                  19476  1 nouveau
ttm                    93424  1 nouveau
drm_kms_helper         55071  1 nouveau
drm                   303102  5 ttm,drm_kms_helper,nouveau
i2c_algo_bit           13413  1 nouveau

$ dpkg -la | grep python2.7
libpython2.7:amd64                                    2.7.6-8ubuntu0.2                                    amd64        Shared Python runtime library (version 2.7)
libpython2.7-minimal:amd64                            2.7.6-8ubuntu0.2                                    amd64        Minimal subset of the Python language (version 2.7)
libpython2.7-stdlib:amd64                             2.7.6-8ubuntu0.2                                    amd64        Interactive high-level object-oriented language (standard library, version 2.7)
python2.7                                             2.7.6-8ubuntu0.2                                    amd64        Interactive high-level object-oriented language (version 2.7)
python2.7-minimal                                     2.7.6-8ubuntu0.2                                    amd64        Minimal subset of the Python language (version 2.7)
pymol                                                 1.7.0.0-1                                           amd64        Molecular Graphics System

Пожалуйста, сообщите. Спасибо.

0
задан 12 May 2016 в 04:34

1 ответ

Pymol начинает хорошо работать без катастрофического отказа Python после того, как я вернусь драйвер Nvidia назад к более старой версии 304.131. Установленный через репозиторий Ubuntu:

sudo apt-get install nvidia-current

You can also specific a version to install, e.g.
sudo apt-get install nvidia-331
sudo apt-get install nvidia-340 

Hope они помогают.

1
ответ дан 12 May 2016 в 14:34
  • 1
    @Scimonster при использовании Уэйленда, Вы, вероятно, должен установить некоторые переменные окружения. Менеджер по Разделу KDE работает любой над X11 (таким образом, Вы можете временный переключатель к X11), или как клиент Уэйленда на Уэйленде. Я don' t думают, что это работает клиентом XWayland на Уэйленде. К сожалению, разработчики Gnome don' t определяют требуемые переменные окружения на своей сессии Уэйленда... Попробуйте " QT_QPA_PLATFORM=wayland partitionmanager". между прочим, don' t выполняют sudo самостоятельно, KPM должен перезапустить себя как корень. Мы медленно работаем над созданием работы KPM без полномочий пользователя root, но it' s не готовый все же. – Andrius Štikonas 26 October 2017 в 07:25

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: