Я должен перезапустить апача каждый раз, когда я обновляю php файл. Это не клиентская проблема кэша браузера, я попробовал несколько браузеров. Странная вещь, я только должен сделать это с php файлами, прекрасные обновления файлов HTML..
Наконец... Неприятности были доставлены OPcache, я просто удалил конфигурацию ini и теперь ее работу:)