На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Границы окон по умолчанию отключены в Ubuntu 14.04. Это может отвлекать, когда окна консоли перекрывают друг друга. Есть ли способ включить их, и если да, то как?
Тема по умолчанию в Ubuntu не показывает границы, но можно включить границы путем установки темы, которая предлагает границы окна. Используйте unity-tweak-tool
для переключения тем. Например, Высококонтрастная тема тянет черную границу.