Я использую Ubuntu 14.04.01 в машине VirtualBox, и Инструмент Тонкой настройки Единицы работает отлично, все.
Однако после установки Ubuntu в резервном диске (не виртуальная машина), Инструмент Тонкой настройки Единицы не изменяет темы и параметры шрифта (вывод подсказок, сглаживаясь и т.д.). Я не протестировал другие настройки, но по крайней мере это изменяет параметры прозрачности панели.
Возможно, это - что-то с драйверами NVIDIA?
Имел ту же проблему после того, как мои 14.10 зависают. Решенный через:
dconf-editor
org.gnome.settings-daemon.plugins.xsettings
active
флажок. Или
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.xsettings active false
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.xsettings active true