Да, кажется, что сценарий обновления дистрибутива не играет хорошо с RAID0. У меня была простая новая установка 12.04 с двумя SSD-дисками в качестве одного диска RAID0, установка grub не удалась аналогичным образом. Загрузка с USB-накопителя и использование средства восстановления загрузки для переустановки GRUB разрешили проблему.