Когда я загружаю свою систему - все ярлыки работают хорошо - какое расположение выбрано. Таким образом, я просто нажимаю ctrl + c и ctrl + v (или на русском языке это будет ctrl + c и ctrl + м), и он работает! После некоторого количества времени (очень отличающийся - могут быть несколько часов или несколько минут) это прекращает работать. Ярлыки теперь начинают работать только в английском расположении.
Я не понимаю, какое событие вызывает эту ошибку. Обычно только 3 приложения открыты в это время: скайп, хром и сублимат.
3.19.0-31-универсальная Ubuntu 15.04
Поэтому приложения, Вы выполняете "английские" сочетания клавиш поддержки, так как они пользовательски определяются.
"российские" ярлыки будут только работать, если они были определены во время разработки как соответствующий ярлык...