На этот вопрос уже есть ответ здесь:
помогите мне, я установил инструменты Kali Linux и классический индикатор меню в Ubuntu 16.04 и после перезагрузки все мои меню пропали, терминал полностью черный и границы окон также черные, Как восстановить это
У меня была та же самая проблема после того, как я установил последнее (бета) графический драйвер для моего ноутбука через PPA. Вы могли попытаться удалить их или в случае, если Вы также используете попытку PPA обновить их через систему updater. В моем обновлении случая через систему updater неделю спустя решил мой вопрос.