Чтобы исключить KeepassX из добавления паролей в историю буфера обмена, добавьте KeepassX в список исключений в
settings -> security and privacy -> files and applications
Таким образом, KeepassX не будет записан в ZeitGeist или Dash и, например, Diodon, не будет добавлять пароли в список истории.