Как я создаю сочетание клавиш для открытия приложения Chrome?

Откройте URL из командной строки: google-chrome http://www.example.com

Открывают URL как приложение из командной строки: google-chrome --app=http://www.example.com

сочетание клавиш Create для открытия URL:
Параметры настройки системы> Клавиатура> Ярлыки> Пользовательский> +
- Имя: Нечто
- Команда: google-chrome http://www.example.com
- Нажимают Apply
- Выбор новая строка, затем нажимают и удерживают желаемые клавиши

сочетание клавиш Create для открытия URL как приложение:
Параметры настройки системы> Клавиатура> Ярлыки> Пользовательский> +
- Имя: Панель
- Команда: google-chrome --app=http://www.example.com
- Нажимают Apply
- Выбор новая строка, затем нажимают и удерживают желаемые клавиши

Найдите свои файлы ярлыков приложения Chrome в: ~/.local/share/applications

Вы найдете там список *.desktop файлы. Во внутренней части они будут выглядеть примерно так:

#!/usr/bin/env xdg-open
[Desktop Entry]
Version=1.0
Terminal=false
Type=Application
Name=Google Drive
Exec=/opt/google/chrome/google-chrome %U --profile-directory=Default --app-id=apdfllckaasghufndbhieahigkjlhiii
Icon=chrome-apdfllckaasghufndbhieahigkjlhiii-Default
NoDisplay=true
StartupWMClass=crx_apdfllckaasghufndbhieahigkjlhiii

Копия, что исполнительная команда к Вашей команде ярлыка.

/opt/google/chrome/google-chrome --profile-directory=Default --app-id=apdfllckaasghufndbhieahigkjlhiii

кредит к @Jacob Vlijm