Вам нужно запустить nvidia-settings, чтобы изменить разрешение. Если у вас нет правильных разрешений, выбираемых в Xserver_Display_Configuration, проверьте файл /etc/X11/xorg.conf для неправильных настроек Vertrefresh и Horizsync и удалите эти строки.
Если репозитории содержат обновление для определенного пакета, то программа обновления обновляет этот пакет.
Установка пакета через программный центр выполняет ту же функцию, что и установка пакета через apt-get.
2] Да, обновления программного обеспечения обновлений пакетов, установленных через программный центр, только если соответствующий пакет имел обновление в разрешенных репозиториях.