Это похоже на специальное программное обеспечение или конфигурацию. Интересно, учитывают ли такие инструменты, как http://www.grano.la.
Если я хорошо вас понял, вы не хотите, чтобы Kubuntu установил GRUB. Вы можете удалить GRUB на Kubuntu:
sudo apt-get remove grub-pc