Если вам нужно было запустить '/etc/init.d/vboxdrv setup' после обновления и перед загрузкой новых модулей ядра, убедитесь, что dkms установлен и обновлен правильно. Это компонент, который перекомпилировал модули при перезагрузке после обновления ядра, он также должен загружать модули по завершении. Это единственное обстоятельство, когда я могу заставить его потерпеть неудачу при тестировании. Если это не так, я возьму совет Элиа и напишу отчет об ошибке.