Каково различие между установкой программы и копированием двоичных файлов программы к некоторому каталогу?

Иногда достаточно для программы использовать, извлечь ее tarball и скомпилировать make-файл, но некоторые программы должны также быть установлены. Я предполагаю, устанавливаю процесс, включает копирование файлов к некоторым определенным каталогам и изменению некоторых конфигурационных файлов.

Мой вопрос, как можно сказать, если программа должна быть установлена, и какие каталоги и конфигурационные файлы должны быть включены в этом случае.