Да, вам нужно программное обеспечение, подобное gnome-power-manager, для вращения жестких дисков. Современные жесткие диски иногда имеют такие функции, как SMART, но это только собирает информацию. Psusi упоминает еще одну большую полезность, hdparm, которая играет с настройками мощности (среди многих других вещей). Hdparm более мощный и более продвинутый, gnome-power-manager, вероятно, проще. Более одного способа кошки кошки.