Я очень рекомендую Imagemagick для этого. После его установки пример команды для того, что вы пытаетесь сделать, будет:
convert -delay 5 img[1-9].png img[1-9][0-9].png img[1-9][0-9][0-9].png output.mov
Обратите внимание, что команда будет проще (и изображения будут отображаться в числовом порядке), если у вас были начальные нули в ваших файлах изображений. Затем вы можете использовать:
convert -delay 5 img*.png output.mov