Попробуем что-то еще:
sudo apt-get install htop
Команда top является традиционным способом просмотра использования ресурсов вашей системы и просмотра процессов, которые занимают большинство системных ресурсов. В верхней части отображается список процессов, в которых используются самые популярные процессоры.
htop отображает ту же информацию с более понятным макетом. Он также позволяет вам выбирать процессы с помощью клавиш со стрелками и выполнять действия, например, убивать их или изменять их приоритет с помощью клавиш F.
Как вы сказали правильно, у скрытых файлов / папок перед именем файла есть ., что указывает на то, что они являются скрытыми файлами, также называемыми dot-файлами.
Я никогда не слышал об этом явлении возможно, или раньше, как вы описали его. Что происходит, когда вы используете команду ls -la в терминале для этого конкретного пути / dir ?! (Эти папки все еще отображаются без .?!)
Если вы уверены, что эти папки являются скрытыми папками, вы можете вручную скрыть их с помощью команды mv (move), например поэтому: mv /media/fun/misc/FOLDER /media/fun/misc/.FOLDER и посмотрите, если это разрешит крах «Показывать скрытые файлы» в Nautilus.