Как изменить каталог по умолчанию для R версии 3.0.2 на указанный пользователем каталог в Ubuntu 14.04?

Скрипт os-prober предназначен для поиска других операционных систем, чем установленная корневая система. Поскольку у вас нет ни одного из них (swap не является операционной системой), os-prober ничего не возвращает.

Чтобы заполнить меню grub, используйте команду sudo update-grub. К ним также относятся смонтированные разделы.