«Выключение» следует понимать с точки зрения системы (все пользователи отключены, больше не работает), а не с точки зрения машины (выключение питания).
Из man shutdown: [!d1 ] Если параметр не указан, действие по умолчанию состоит в том, чтобы привести систему в однопользовательский режим.
Если вы хотите на самом деле отключить машину:
Если параметр не указан, действие по умолчанию - привести систему в однопользовательский режим.
-H Требует остановки системы после ее сбрасывания.
-h Требует, чтобы система была остановлена или выключена после того, как она была сбита, с выбором, который остался до системы.