Как создать пакет Debian с непересекающимися / альтернативными зависимостями?

Это все правильно. Ваша карта основана на наборе микросхем Nvidia NV20, который не поддерживает 3D-поддержку с помощью драйверов Nouveau.

Большая часть из них - WIP, а не полностью работающая или такая неоднородная, что нельзя считать способной для запуска Unity3D.

Для полной поддержки вашей видеокарты вам необходимо установить драйверы Nvidia 96.43 (это самые последние, которые поддерживает ваша карта). Если вы еще не установили какие-либо драйверы в вашей системе до сих пор, просто откройте терминал и используйте следующие команды

sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install nvidia-96

Перезагрузитесь, и вы должны использовать только что установленный драйвер Nvidia. Чтобы убедиться, что запустите sudo lshw -C display и найдите драйвер, используемый в конфигурации: driver = line.