Как предложил NGRhodes, я изменил зависимости на
Depends: openjdk-7-jre-headless | java-runtime-headless, ...
Recommends: ...
Теперь я могу установить его с помощью
$ sudo dpkg -i MYAPP.deb
и установить отсутствующие зависимости с помощью
$ sudo apt-get -f install