vim-gnome имеет эту проблему, но vim-gtk этого не делает, поэтому это быстрое решение проблемы:
sudo apt remove vim-gnome
sudo apt install vim-gtk
tmpfs можно использовать для каталогов log / tmp / spool. Затем после перезагрузки они полностью очищаются. https://en.wikipedia.org/wiki/Tmpfs
$ sudo vim /etc/fstab
tmpfs /tmp tmpfs defaults,noatime,size=2024M,mode=1777 0 0
tmpfs /var/spool tmpfs defaults,noatime,size=512M,mode=1777 0 0
tmpfs /var/tmp tmpfs defaults,noatime,size=512M,mode=1777 0 0
tmpfs /var/log tmpfs defaults,noatime,size=512M,mode=0755 0 0