Вернуть возможность использования жесткого диска компьютера из портативной системы

Я обнаружил, что намного легче отказаться от небольшого раздела и переместить /boot в корень.

Сначала переместите ваши данные из загрузочного раздела в root (запустите как sudo -s):

cp -a /boot /boot2
umount /boot
rmdir /boot
mv /boot2 /boot

Удалите (или комментарий) запись /boot в /etc/fstab:

vim /etc/fstab

Обновите grub и убедитесь, что все правильно:

update-grub

apt теперь может обновить без проблем.

Это оставляет неиспользуемый раздел 200mb (который вы могли бы использовать для чего-то другого, если вы сочтете это проблемой).