Была ли та же проблема с Idea IntelliJ 2016.2
Вы должны установить для себя пользователя и группу своей папки идей. (или группа, которую вы делите с другими пользователями, если вам нужно)
В моем случае это было потому, что некоторые файлы в идее были назначены root: root, и я не видел смысла. [ ! d2]
Итак, я побежал: sudo chown -R jcharlet:jcharlet /opt/idea-IC-162.1121.32