К сожалению, удаленный сервер Linux может не всегда правильно запускаться, а затем требует вмешательства человека (на сайте).
Иногда это может быть разрешено с использованием оборудования always который поддерживает циклическое включение питания (включено, выключено) и / или подключение последовательной консоли.
Использовать
cp -R
Указывает рекурсивную копию, то есть все подкаталоги и файлы будут скопированы. Используйте man cp, чтобы найти дополнительные ключи для cp.
cp по умолчанию не копирует каталоги. Из man 1posix cp:
2. If source_file is of type directory, the following steps shall be
taken:
a. If neither the -R or -r options were specified, cp shall write
a diagnostic message to standard error, do nothing more with
source_file, and go on to any remaining files.
У вас должно получиться такое сообщение:
cp: omitting directory '...'
Например:
$ cp Documents Pictures
cp: omitting directory ‘Documents’
Как может быть видно из manpage, используйте -r или -R с cp:
cp -R Documents Pictures